某一日,被称为“巨人”的体型格外巨大的怪物入侵了人类的世界,他们的破坏力是如此的巨大,以至于人来在极短的时间里便失去了大片的土地。为了保护最后的生存家园,人类建造起了高墙,犹如被圈养般的生活在极有限的空间中,生活在无止尽的恐惧之中,这样一过就是一百年。
艾伦(梶裕贵配音)、三笠(石川由衣饰)和阿尼(嶋村侑饰)是生活在高墙之后的孩子们,艾伦痛恨调查兵团日渐懒散的作风,认为巨人有朝一日一定会向人类发起更猛烈的进攻。不幸的是,艾伦的预言实现了,超大型的巨人打破了墙壁,在人类最后的净土中肆虐。灾难过后,幸存的艾伦一行人加入了调查兵团,艾伦和三笠更是发誓要为死去的母亲报仇。哦,对了,阿源,你的飞车还在那个小山谷里呢,不知道那些黑衣人回去的时候有没有动它,但愿他们没有把你的飞车开走,或者干脆把它砸了。